Özel zincirler, ağı yöneten merkezi bir varlık kullandıkları için halka açık zincirlerde farklıdır. Normalde bu tür blokzinciri teknolojisine katılanların blokzincirini okumak, yazmak veya denetlemek için yöneticiden izin alması gerekir. Bu nedenle, özel zincirler “yönetilen blokzincirleri” olarak bilinir; halka açık zincirlerin aksine, özel blokzincirleri merkeziyetsiz değildir.
Ayrıca, merkezi kuruluş farklı erişim seviyeleri verme ve katılımcılara roller atama yetkisine de sahiptir. Bu izin verildikten sonra, özel bir zincir genel bir zincire benzer şekilde çalışır, katılımcılar madencilik haklarına, işlem yapma haklarına ve blokzincirindeki mevcut işlemleri düzenleme yeteneğine sahiptir.
Özel blokzincirleri daha çok işletmelerde ve düzenleme gücüne sahip bir protokol gerektiren kapalı ortamlarda bulunur. Bu sayede kuruluş, önemli verileri harici taraflara ifşa etmeden ve gizliliği koruyarak dağıtılmış bir dijital defter tutabilir. Bununla birlikte, halka açık bir blokzincirine benzer şekilde, ağ operatörleri blokzincirine eklemeden önce işlemleri doğrulamalıdır.
En popüler özel zincirlere örnek olarak şunlar verilebilir: Morpheus.Network (MNW), Patientory (PTOY), ve Hyperledger.
